Para cambiar la puerta de enlace desde línea de comandos usamos netsh. Para ello primero eliminamos la puerta de enlace "vieja":

netsh interface ip delete address "<nombre de conexión>" gateway=all

A Continuación establecemos la nueva puerta de enlace:

netsh interface ip add address "<nombre de conexión>" gateway=<ip de la puerta de enlace> gwmetric=auto

En el siguiente ejemplo cambiaremos a la conexión "Conexión de área local" la puerta de enlace, quitando la que hubiera y poniendo en su lugar 192.168.0.2.

netsh interface ip delete address "Conexion de área local" gateway=all
netsh interface ip add address "Conexion de área local" gateway=192.168.0.1 gwmetric=auto