/n = abre nueva carpeta
/e = explorador en dos ventanas (panel del árbol y panel de detalle)
/select = carpeta o unidad seleccionada
/root = nivel superior en el explorador (si se le indica c:\Pepe no se podrá acceder a c:\ ni ninguna de sus carpetas excepto c:\Pepe y sus subcarpetas).

Ejemplos:

"%SystemRoot%\explorer.exe /n, c:\" - Abre una carpeta simple en c:\
"%SystemRoot%\explorer.exe /e, d:\Perico" - Abre una carpeta con árbol en d:\Perico
"%SystemRoot%\explorer.exe /e, d:\Perico, /select, d:\Perico\Pedrito.txt" - Abre una carpeta con árbol en d:\Perico y con el fichero Pedrito.txt seleccionado
"%SystemRoot%\explorer.exe /n, /root, e:\Julianete" - Abre una carpeta simple con raiz en e:\Julianete
"%SystemRoot%\explorer.exe /e, /root, e:\Julianete" - Abre una carpeta con árbol con raiz en e:\Julianete